Né en 1949 à Morlaix dans le Finistère, Jacques Faujour obtient un BTS en photographie en 1971 à l’École nationale supérieure Louis-Lumière.
Il vit à Saint-Maur-des-Fossés dans le Val-de-Marne depuis 1974.
En 1973, il entre au Centre National d’Art Contemporain (C.N.A.C.) comme photographe. En 1975, le C.N.A.C. est intégré au Musée National d’Art Moderne (Centre Georges Pompidou) où Jacques Faujour travaillera jusqu’en 2000. De 2000 à 2010, il est photographe indépendant spécialisé dans la reproduction d’œuvres d’art.
Parallèlement, il poursuit depuis 1971 un travail personnel soutenu à Paris par la galerie Weiller..